Under højaltret befinder sig relikvierne af St. Leonard, en 1800 tals franciskanermunk. Han grundlagde traditionen med korsvejsandagterne i Colosseum, en skik som pave Johannes Paul II fortsatte med hver langfredag.

St. Leonard etablerede desuden Via Crucis på Via S. Bonaventura.  Et Madonna-billede og et krucifiks, som han benyttede i sine andagter, opbevares i kirken, respektive til højre og venstre i koret.

St. Leonard døde her i 1751 og det er muligt at bese hans opholdsværelser.

I kirken hænger flere af den danske munk Fra Pietro’s billeder. Før optagelsen i franciskanerordenen og indflytning på S. Bonaventura var han berømt som genremaler, specielt hans smukke og livlige romerske skriverscener var københavnernes foretrukne motiver.